Gelelektroforese kan utføres i enten horisontal eller vertikal orientering. Horisontale geler er vanligvis sammensatt av en agarosematrise. Porestørrelsene til disse gelene avhenger av konsentrasjonen av kjemiske komponenter: agarosegelporene (100 til 500 nm diameter) er større og mindre ensartede sammenlignet med akrylamidgelporene (10 til 200 nm i diameter). Til sammenligning er DNA- og RNA-molekyler større enn en lineær proteinstreng, som ofte denatureres før eller under denne prosessen, noe som gjør dem lettere å analysere. Dermed kjøres DNA- og RNA-molekyler oftere på agarosegeler (horisontalt). Vårt DYCP-31DN-system er et horisontalt elektroforesesystem. Denne støpte gelstøpeanordningen kan lage 4 forskjellige størrelser geler av forskjellige gelbrett.
