Et elektroforesesystem består av to hovedkomponenter: en strømforsyning og et elektroforesekammer. Strømforsyningen leverer strøm."Kraften", i dette tilfellet, er elektrisitet.Elektrisiteten som kommer fra strømforsyningen flyter, i én retning, fra den ene enden av elektroforesekammeret til den andre.Katoden og anoden i kammeret er det som tiltrekker seg motsatt ladede partikler.
Inne i elektroforesekammeret er det et brett - mer presist et støpebrett.Støpebrettet består av følgende deler: glassplate som går i bunnen av støpebrettet.Gelen holdes i støpebrettet."Kammen" ser ut som navnet. Kammen plasseres i spor på siden av støpebrettet. Den settes i sporene FØR den varme, smeltede gelen helles.Etter at gelen har stivnet, tas kammen ut."Tennene" på kammen etterlater små hull i gelen som vi kaller "brønner".Brønner lages når den varme, smeltede gelen størkner rundt tennene på kammen.Kammen trekkes ut etter at gelen er avkjølt, og etterlater brønner.Brønnene gir et sted å sette partiklene du ønsker å teste.En person må være veldig forsiktig med å forstyrre gelen når man laster partiklene.Å sprekke eller bryte gelen vil sannsynligvis påvirke resultatene dine.